Hi doug
It worked.
Thanks.
All the best.
Rujing Zha
 
2014-03-18
charujing123
发件人：Douglas N Greve <greve@nmr.mgh.harvard.edu>
发送时间：2014-03-17 23:26
主题：Re: [Freesurfer] Fw: Re: view time course in freeview
收件人："freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu>
抄送：
 
 
Try 
tksurfer subjectname rh inflated -t rh.ttest.thickness.10.mgh 
 
It prints out the usage so that you can try to figure these things out  
for yourself, which may be faster than waiting for us to reply 
 
doug 
 
 
On 03/15/2014 01:33 AM, charujing123 wrote: 
> Hi doug and other FS experts, 
> Thanks very much doug. 
> rh.ttest.thickness.10.mgh is created from the mris_preproc to merge  
> all the subjects' thickness into one file. Then group t-test can be done. 
> I try tksurfer -t rh.ttest.thickness.10.mgh, but the command window  
> echoes its usage. 
> Just as you told me freeview has a new version to see time course for  
> this file. I wonder where I can download it. 
> Thanks doug, 
> All the best. 
> Rujing Zha 
> 2014-03-13 
> ------------------------------------------------------------------------ 
> charujing123 
> ------------------------------------------------------------------------ 
> *发件人：*Douglas Greve <greve@nmr.mgh.harvard.edu> 
> *发送时间：*2014-03-12 22:57 
> *主题：*Re: [Freesurfer] view time course in freeview 
> *收件人：*"freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu> 
> *抄送：* 
> 
> But what is in rh.ttest.thickness.10.mgh? Is it a stack of all your  
> subjects (the file you passed with --y to mri_glmfit)? If so, then add  
> "-t rh.ttest.thickness.10.mgh" to your tksurfer command line. Ruopeng  
> just added something to freeview to do it, but you'd have to get a new  
> version 
> 
> doug 
> 
> 
> On 3/11/14 9:46 PM, charujing123 wrote: 
>> Hi doug, 
>> sig.mgh is my result for two group t-test on pial thickness of whole  
>> brain. So I want to see the time course of thickness of  
>> rh.ttest.thickness.10.mgh vertex by vertex. 
>> Thanks. 
>> All the best. 
>> Rujing Zha 
>> 2014-03-12 
>> ------------------------------------------------------------------------ 
>> charujing123 
>> ------------------------------------------------------------------------ 
>> *发件人：*Douglas N Greve <greve@nmr.mgh.harvard.edu> 
>> *发送时间：*2014-03-12 00:16 
>> *主题：*Re: [Freesurfer] view time course in freeview 
>> *收件人：*"freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu> 
>> *抄送：* 
>> the time course of what? 
>> On 03/11/2014 07:18 AM, charujing123 wrote: 
>> > Hi FS experts, 
>> > For the sig.mgh, can I see the time course vertex by vertex in  
>> freeview? 
>> > Thanks. 
>> > All the best. 
>> > Rujing Zha 
>> > 
>> > 
>> > _______________________________________________ 
>> > Freesurfer mailing list 
>> > Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
>> > https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
>> --  
>> Douglas N. Greve, Ph.D. 
>> MGH-NMR Center 
>> greve@nmr.mgh.harvard.edu 
>> Phone Number: 617-724-2358 
>> Fax: 617-726-7422 
>> Bugs: surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/BugReporting 
>> FileDrop: https://gate.nmr.mgh.harvard.edu/filedrop2 
>> www.nmr.mgh.harvard.edu/facility/filedrop/index.html 
>> Outgoing: ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/transfer/outgoing/flat/greve/ 
>> _______________________________________________ 
>> Freesurfer mailing list 
>> Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
>> https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
>> The information in this e-mail is intended only for the person to  
>> whom it is 
>> addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and  
>> the e-mail 
>> contains patient information, please contact the Partners Compliance  
>> HelpLine at 
>> http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to  
>> you in error 
>> but does not contain patient information, please contact the sender  
>> and properly 
>> dispose of the e-mail. 
>> 
>> 
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> 
> 
> 
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> Freesurfer mailing list 
> Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
> https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
 
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Douglas N. Greve, Ph.D. 
MGH-NMR Center 
greve@nmr.mgh.harvard.edu 
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Fax: 617-726-7422 
 
Bugs: surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/BugReporting 
FileDrop: https://gate.nmr.mgh.harvard.edu/filedrop2 
www.nmr.mgh.harvard.edu/facility/filedrop/index.html 
Outgoing: ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/transfer/outgoing/flat/greve/ 
 
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