brain@l4n:/media/sf_share/freesurfer/7.3.2/subjects/diffusion_tutorial$ tree
.
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|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V1_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.V2_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.aparc.DKTatlas.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.a2009s.annot
|   |   |   |-- lh.aparc.annot
|   |   |   |-- lh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- lh.cortex.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- lh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc3v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.hOc4v.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- lh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- lh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- lh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.BA1_exvivo.thresh.label
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|   |   |   |-- rh.aparc.DKTatlas.annot
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|   |   |   |-- rh.aparc.annot
|   |   |   |-- rh.cortex+hipamyg.label
|   |   |   |-- rh.cortex.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.label
|   |   |   |-- rh.entorhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |   |-- rh.hOc1.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc2.mpm.vpnl.label
|   |   |   |-- rh.hOc3v.mpm.vpnl.label
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|   |   |   |-- rh.mpm.vpnl.annot
|   |   |   |-- rh.nofix.cortex.label
|   |   |   |-- rh.perirhinal_exvivo.label
|   |   |   `-- rh.perirhinal_exvivo.thresh.label
|   |   |-- mri
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|   |   |   |-- aseg.auto.mgz
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.label_intensities.txt
|   |   |   |-- aseg.auto_noCCseg.mgz
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|   |   |   |-- aseg.presurf.mgz
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|   |   |   |-- brainmask.mgz
|   |   |   |-- ctrl_pts.mgz
|   |   |   |-- filled.auto.mgz
|   |   |   |-- filled.mgz
|   |   |   |-- lh.ribbon.mgz
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log
|   |   |   |-- mri_nu_correct.mni.log.bak
|   |   |   |-- norm.mgz
|   |   |   |-- nu.mgz
|   |   |   |-- orig
|   |   |   |   `-- 001.mgz
|   |   |   |-- orig.mgz
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|   |   |   |-- rawavg.mgz
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|   |   |   |-- ribbon.mgz
|   |   |   |-- segment.dat
|   |   |   |-- surface.defects.mgz
|   |   |   |-- talairach.label_intensities.txt
|   |   |   |-- talairach.log
|   |   |   |-- talairach_with_skull.log
|   |   |   |-- transforms
|   |   |   |   |-- bak
|   |   |   |   |-- cc_up.lta
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.auto.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach.lta
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|   |   |   |   |-- talairach.xfm
|   |   |   |   |-- talairach.xfm.lta
|   |   |   |   |-- talairach_avi.log
|   |   |   |   |-- talairach_avi_QA.log
|   |   |   |   |-- talairach_with_skull.lta
|   |   |   |   `-- talsrcimg_to_711-2C_as_mni_average_305_t4_vox2vox.txt
|   |   |   |-- wm.asegedit.mgz
|   |   |   |-- wm.mgz
|   |   |   |-- wm.seg.mgz
|   |   |   `-- wmparc.mgz
|   |   |-- scripts
|   |   |   |-- build-stamp.txt
|   |   |   |-- defect2seg.log
|   |   |   |-- lastcall.build-stamp.txt
|   |   |   |-- patchdir.txt
|   |   |   |-- pctsurfcon.log
|   |   |   |-- pctsurfcon.log.old
|   |   |   |-- ponscc.cut.log
|   |   |   |-- recon-all-status.log
|   |   |   |-- recon-all.cmd
|   |   |   |-- recon-all.done
|   |   |   |-- recon-all.env
|   |   |   |-- recon-all.local-copy
|   |   |   |-- recon-all.log
|   |   |   |-- recon-config.yaml
|   |   |   `-- unknown-args.txt
|   |   |-- stats
|   |   |   |-- aseg.stats
|   |   |   |-- brainvol.stats
|   |   |   |-- lh.BA_exvivo.stats
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|   |   |   `-- wmparc.stats
|   |   |-- surf
|   |   |   |-- autodet.gw.stats.lh.dat
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|   |   |   |-- lh.area
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|   |   |   |-- lh.defect_borders
|   |   |   |-- lh.defect_chull
|   |   |   |-- lh.defect_labels
|   |   |   |-- lh.defects.pointset
|   |   |   |-- lh.fsaverage.sphere.reg
|   |   |   |-- lh.inflated
|   |   |   |-- lh.inflated.H
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|   |   |   |-- lh.jacobian_white
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|   |   |   |-- rh.defect_chull
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|   |   |   |-- rh.defects.pointset
|   |   |   |-- rh.fsaverage.sphere.reg
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|   |   |   |-- rh.inflated.H
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|   |   |   |-- rh.sphere
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|   |   |   |-- rh.white
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|   |   |   |-- rh.white.preaparc.H
|   |   |   `-- rh.white.preaparc.K
|   |   |-- tmp
|   |   |-- touch
|   |   |   |-- apas2aseg.touch
|   |   |   |-- asegmerge.touch
|   |   |   |-- ca_label.touch
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|   |   |   |-- lh.tessellate.touch
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|   |   `-- trash
|   `-- subject2.nii.gz
|-- raw
|   |-- subject1
|   |   |-- dwi1
|   |   |   |-- subject1.nii
|   |   |   |-- subject1.nii.gz
|   |   |   |-- subject1_bval.txt
|   |   |   `-- subject1_bvec.txt
|   |   `-- dwi2
|   |       |-- subject1.nii
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|   |       `-- subject1_bvec_PA.txt
|   `-- subject2
|       |-- dwi1
|       |   |-- subject2.nii
|       |   |-- subject2.nii.gz
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|       `-- dwi2
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`-- trc
    `-- subject1
        |-- dlabel
        |   `-- diff
        |       `-- lowb_brain_mask.nii.gz
        |-- dmri
        |   |-- acqp.txt
        |   |-- b02b0.cnf
        |   |-- dwi.bvals
        |   |-- dwi.bvecs
        |   |-- dwi.eddy_command_txt
        |   |-- dwi.eddy_movement_rms
        |   |-- dwi.eddy_outlier_map
        |   |-- dwi.eddy_outlier_n_sqr_stdev_map
        |   |-- dwi.eddy_outlier_n_stdev_map
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        |   |-- dwi_orig_las.bvals
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        |   |-- index.txt
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        |   |-- lowb_topup.nii.gz
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        |   |-- lowb_topup_brain_mask.nii.gz
        |   |-- topup_fieldcoef.nii.gz
        |   |-- topup_movpar.txt
        |   `-- xfms
        `-- scripts
            |-- build-stamp.txt
            |-- csurfdir
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