Dear Bruce,
I did setup the "-run 015" not "013" in unpacksdcmdir as I told in previous message. But it generated the "013" folder automatically after running unpacksdcdir, which made me so confused.
As it created the "013" folder, I guess unpacksdcmdir didnot recognized structure image correctly which was in the "15th" line of the scan.info.
Thanks Bruce.
All the best.
 
2013-12-16
Rujing Zha
发件人：Bruce Fischl <fischl@nmr.mgh.harvard.edu>
发送时间：2013-12-16 22:12
主题：Re: [Freesurfer] unpacksdcmdir: specifies unpacking rules from the command-line ERROR
收件人："Rujing Zha"<charujing123@163.com>
抄送："freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu>
 
but why are you giving recon-all the path to run 013 instead of 015? I  
don't know the fsfast file structure, but your scan.info says that 013 is  
an EPI fun and 015 is the mprage 
 
On Sat,  
14 Dec 2013, Rujing Zha wrote: 
 
> Hi Bruce, 
> It generated a 013 subfolder in after running this code "unpacksdcmdir 
> -src ../data/liujunhao -targ ../work/liujunhao -fsfast -run 015 3danat mgz 
> 001.mgz". It is 15 that I can see the number of  t1_mpr_ns_sag_iso_zhang in 
> the unpack.log. 
> Then I ran "recon-all -i ../work/liujunhao/3danat/013/001.mgz -s liujunhao", 
> and it finished without error. 
> "recon-all -s liujunhao -all" was run and ERROR would be displayed: 
> ERROR: input(s) cannot have multiple frames! 
> The recon-all.log unpack.log and scan.info were unloaded in the attachment. 
> Thanks. 
> All the best. 
>   
> 2013-12-14 
>  
> ____________________________________________________________________________ 
> Rujing Zha 
>  
> 
_______________________________________________ 
Freesurfer mailing list 
Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
 
 
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is 
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail 
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at 
http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error 
but does not contain patient information, please contact the sender and properly 
dispose of the e-mail.