Dear Freesurfer-experts,

I want to create my own ROI for purposes of cortical thickness measurements in Freesurfer. As input, I have a binary_volume_mask.mgz. But I'm lacking to get this mask as a label or volume into the FS structure.

I already tryed the mri_vol2surf and mri_vol2roi, unfortunately without successs.

Looking forward to hearing your suggestion,

Best, Andreas Niebuhr

..................................................................................

Bitte denken Sie an Ihre Verantwortung gegenüber der Umwelt, bevor Sie diese E-Mail drucken.

Die in dieser Nachricht enthaltenen Informationen können vertraulich sein und sind ausschließlich für den Adressaten bestimmt. Sollten Sie nicht der vorgesehene Empfänger sein, so bitte ich Sie, den Absender unverzüglich zu informieren und die E-Mail zu löschen. Eine nicht autorisierte Verwendung, Verbreitung oder Kopie ist nicht gestattet. Ich weise darauf hin, dass über das Internet per E-Mail übermittelte Nachrichten verändert oder verfälscht werden können. Herkömmliche E-Mails sind nicht gegen den Zugriff Dritter geschützt, so dass unter Umständen auch die Vertraulichkeit nicht gewahrt sein kann. Von der Übermittlung sensibler Geschäftsdaten sollten Sie daher absehen.