Do you mean the threshold?
min=2.0
max=5.0
 
 
Thanks!
 
【小孔成像】http://www.conxz.net
 
From: Bruce Fischl
Date: 2013-06-28 20:57
To: Xiangzhen Kong
CC: freesurfer
Subject: Re: Re: [Freesurfer] tksurfer display problem
sorry, I didn't notice that. What were your min and max set to?
On Fri, 28 
Jun 2013, Xiangzhen Kong wrote:
 
> Thanks very much.
> Another problem, do you know why the color bar is inversed in my first
> email?
> Might it be related to the right-left weird problem?
>  
> 
> ____________________________________________________________________________
> 【小孔成像】http://www.conxz.net
>  
> From: Bruce Fischl
> Date: 2013-06-28 11:18
> To: Xiangzhen Kong
> CC: freesurfer
> Subject: Re: [Freesurfer] tksurfer display problem
> There is no config that would do that. Fsaverage is somewhat unique in that
> the lh and rh have the same number of vertices. All I can think of is to
> download it again and see if that fixes your problem
> Bruce
> 
> 
> 
> On Jun 27, 2013, at 10:51 PM, "Xiangzhen Kong" <bnucon@gmail.com> wrote:
>
>        
> Actually when I just use "tksurfer fsaverage lh inflated", there is
> the similar problem.
> And fsaverage was copied from freesufer by recon-all.
> So I think there might be something wrong with using tksurfer, e.g.,
> config.
>  
> 
> ____________________________________________________________________________
> 【小孔成像】http://www.conxz.net
>  
> From: Bruce Fischl
> Date: 2013-06-28 10:28
> To: Xiangzhen Kong
> CC: freesurfer
> Subject: Re: [Freesurfer] tksurfer display problem
> Are you sure you didn't accidentally copy the rh over lh
> 
> 
> 
> On Jun 27, 2013, at 9:31 PM, "Xiangzhen Kong" <bnucon@gmail.com>
> wrote:
>
>       Hi all.
> I want to display a result with tksurfer. The cmd is here:
> tksurfer fsaverage lh inflated -overlay
> ./fwhm10lh/c1.contrast/sig.mgh
> That is, I want to display the result of the left hemi.
> However, to my surprise, the plot seems like on the right hemi
> of the brain.
> In addition, the color bar is also strange.
> The plot is attached.
> I wonder whether this is normal or something may be wrong.
>  
>  
>  
> 
> ____________________________________________________________________________
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>
>       <test.jpg>
>
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> e-mail
> contains patient information, please contact the Partners Compliance
> HelpLine at
> http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you
> in error
> but does not contain patient information, please contact the sender
> and properly
> dispose of the e-mail.
>
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