Hi Doug and others,

Thanks Doug.

I modifiled my number of class in the fsgd which can be got in the attachment.

And I am confused with 3 problems:

1st: Is what I modified proper?

2nd: How can I deal with my high correlation between age and edu?

3rd: Is it necessary to tell mri_glmfit to distinguish which subject is female or male in each class if dividing all subjects into 2 classes (i.e con and IA )?

Thanks in advance.

All the best.

 

2013-12-19

---

Rujing Zha

---

发件人：Douglas N Greve <greve@nmr.mgh.harvard.edu>

发送时间：2013-12-19 04:59

主题：Re: [Freesurfer] mri_glmfit error

收件人："freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu>

抄送：

 

 

Could be several things. You only have two IA_female and and only 3  

con_female. Also, the age and edu are highly correlated. I would try  

creating a single IA group with males and females and a single con group 

doug 

 

 

On 12/18/2013 11:21 AM, Rujing Zha wrote: 

> Hi all, 

> I try to run mri_glmfit, but it export 

> "ERROR: matrix is ill-conditioned or badly scaled, condno = 1e+08 

> -------------------------------- 

> Possible problem with experimental design: 

> Check for duplicate entries and/or lack of range of 

> continuous variables within a class.". 

> I upload the data in the attachment, and the glmfit_output is the  

> standard output of the "mri_glmfit". 

> Thanks. 

> All the best. 

> 2013-12-19 

> ------------------------------------------------------------------------ 

> /Rujing Zha/ 

> 

> 

> _______________________________________________ 

> Freesurfer mailing list 

> Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 

> https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 

 

--  

Douglas N. Greve, Ph.D. 

MGH-NMR Center 

greve@nmr.mgh.harvard.edu 

Phone Number: 617-724-2358 

Fax: 617-726-7422 

 

Bugs: surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/BugReporting 

FileDrop: https://gate.nmr.mgh.harvard.edu/filedrop2 

www.nmr.mgh.harvard.edu/facility/filedrop/index.html 

Outgoing: ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/transfer/outgoing/flat/greve/ 

 

_______________________________________________ 

Freesurfer mailing list 

Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 

https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 

 

 

The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is 

addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail 

contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at 

http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error 

but does not contain patient information, please contact the sender and properly 

dispose of the e-mail.