## Usa . invece di source per maggiore compatibilit���
. $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh || echo "Errore nel caricare SetUpFreeSurfer.sh"

## Percorsi TRACULA
export TRACULA_DATA="/home/gabriellam/Desktop/soggetto_prova_007_S_6341/prova_tracula"
echo "Verifico esistenza directory TRACULA: $TRACULA_DATA"
ls -la $TRACULA_DATA || echo "Percorso TRACULA non accessibile"

export SUBJECTS_DIR=$TRACULA_DATA/fs
echo "SUBJECTS_DIR: $SUBJECTS_DIR"

## Verifica directory corrente prima e dopo
pwd
cd $TRACULA_DATA || echo "Non posso accedere a $TRACULA_DATA"
pwd

## Verifica esistenza del file di configurazione
ls -la dmrirc.mio_config.tcsh || echo "File dmrirc.mio_config.tcsh non trovato"

### Step1: trac-all preprocessing 

trac-all -prep -c dmrirc.mio_config.tcsh

### Step2: trac-all bedpostx

trac-all -bedp -c dmrirc.mio_config.tcsh 

### Step3: trac-all -path 

trac-all -path -c dmrirc.mio_config.tcsh