Hi Doug and others,
Thanks Doug.
I modifiled my number of class in the fsgd which can be got in the attachment.
And I am confused with 3 problems:
1st: Is what I modified proper?
2nd: How can I deal with my high correlation between age and edu?
3rd: Is it necessary to tell mri_glmfit to distinguish which subject is female or male in each class if dividing all subjects into 2 classes (i.e con and IA )?
Thanks in advance.
All the best.
 
2013-12-19
Rujing Zha
发件人：Douglas N Greve <greve@nmr.mgh.harvard.edu>
发送时间：2013-12-19 04:59
主题：Re: [Freesurfer] mri_glmfit error
收件人："freesurfer"<freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu>
抄送：
 
 
Could be several things. You only have two IA_female and and only 3  
con_female. Also, the age and edu are highly correlated. I would try  
creating a single IA group with males and females and a single con group 
doug 
 
 
On 12/18/2013 11:21 AM, Rujing Zha wrote: 
> Hi all, 
> I try to run mri_glmfit, but it export 
> "ERROR: matrix is ill-conditioned or badly scaled, condno = 1e+08 
> -------------------------------- 
> Possible problem with experimental design: 
> Check for duplicate entries and/or lack of range of 
> continuous variables within a class.". 
> I upload the data in the attachment, and the glmfit_output is the  
> standard output of the "mri_glmfit". 
> Thanks. 
> All the best. 
> 2013-12-19 
> ------------------------------------------------------------------------ 
> /Rujing Zha/ 
> 
> 
> _______________________________________________ 
> Freesurfer mailing list 
> Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
> https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
 
--  
Douglas N. Greve, Ph.D. 
MGH-NMR Center 
greve@nmr.mgh.harvard.edu 
Phone Number: 617-724-2358 
Fax: 617-726-7422 
 
Bugs: surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/BugReporting 
FileDrop: https://gate.nmr.mgh.harvard.edu/filedrop2 
www.nmr.mgh.harvard.edu/facility/filedrop/index.html 
Outgoing: ftp://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/transfer/outgoing/flat/greve/ 
 
_______________________________________________ 
Freesurfer mailing list 
Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu 
https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer 
 
 
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is 
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail 
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at 
http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error 
but does not contain patient information, please contact the sender and properly 
dispose of the e-mail.