Dear Freesurfer experts,  

 
 

I get this error when I am running FreeSurfer. 

 
 

 

Checking for (invalid) multi-frame inputs... 
ERROR: input(s) cannot have multiple frames! 
/home/knutjb/subjects/test/mri/orig/001.mgz has 4 frames 
If this is a multi-frame MEMPRAGE image, 
use mri_concat --rms to combine echo frames. 

 
 

It has a t1_sag_mprage sequence, and it also give this waning 

filesare not found to be different and cannot be sorted. 

 
 

In addition, I get these errors when importing using recon-all -i file -all -s test 

 
 

INFO: Found 770 files in //20210224_151919/5_t1_sag_mprage 
INFO: Scanning for Series Number 5 
Scanning Directory 
INFO: found 768 files in series 
INFO: loading series header info.  

 
 

When I am running mri_concat --rms I am able to run recon-all -all. 

 
 

Your sincerely, 

 

Knut Jørgen Bjuland