<div dir="ltr">Hi Xiaoxiao,<div><br></div><div>it turns out I misread your question.</div><div>If you want to add the electrode positions manually</div><div>you have to update the corresponding fields in the <a href="http://raw.info" target="_blank">raw.info</a>[&#39;chs&#39;] for each channel. It&#39;s the first three entries in the &#39;loc&#39; and the the first row of the matrix in &#39;eeg_loc&#39;.</div>


<div><br></div><div>To give an example:</div><div><br></div><div><a href="https://github.com/dengemann/mne-python/blob/montage/mne/montages/montage.py#L166" target="_blank">https://github.com/dengemann/mne-python/blob/montage/mne/montages/montage.py#L166</a><br>


</div><div><br></div><div>HTH,</div><div>Denis</div><div><br></div><div> </div><div><br></div><div><br><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 3, 2014 at 2:15 AM, Xiaoxiao Bai <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:baixx013@gmail.com" target="_blank">baixx013@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear Denis,<br><br></div><div><div>
Thank you for your help.<br><br></div>elc = mne.fiff.kit.read_elp() get electrode locations  acquired from Polhemus system. <br><br>raw = mne.io.egi.read_raw_egi() get fif data object from EGI raw data file.<br>
<br></div><div>We want to add electrode locations elc into raw rather than epochs.<br><br></div><div>Best<span><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span><font color="#888888"><div>Xiaoxiao<br>
</div></font></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 6:32 PM, Denis A. Engemann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:denis.engemann@gmail.com" target="_blank">denis.engemann@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>



<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="auto"><div>Hi,</div><div><br></div><div>we currently only support that at the epochs stage:</div>


<div><br></div>
<div><a href="http://martinos.org/mne/dev/generated/mne.epochs.add_channels_epochs.html" target="_blank">http://martinos.org/mne/dev/generated/mne.epochs.add_channels_epochs.html</a></div><div><br></div><div>you need compatible sampling rates</div>



<div><br></div><div>HTH,</div><div>Denis</div><div><div><div><br>On Jul 3, 2014, at 12:17 AM, Xiaoxiao Bai &lt;<a href="mailto:baixx013@gmail.com" target="_blank">baixx013@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br></div>
<blockquote type="cite"><div><div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Denis,<br><br></div><div>Thank you for your help. I have another simple question about saving elp and EGI raw as a fif file.<br></div><div><br></div>I use raw = mne.io.egi.read_raw_egi() to read EGI raw data and elc = mne.fiff.kit.read_elp() to read elp file.<br>




<br></div>How can I combine raw and elc and save them into one fif file?<br><br></div>Best<br><br></div>Xiaoxiao<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 2:50 PM, Denis-Alexander Engemann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:denis.engemann@gmail.com" target="_blank">denis.engemann@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>




<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra">Xiaoxiao, great!<br>


<br>Glad to hear it worked.</div><div class="gmail_extra">
<br>
</div><div class="gmail_extra">Best,</div><div class="gmail_extra">Denis</div><div><div><div class="gmail_extra">

<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 8:36 PM, Xiaoxiao Bai <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:baixx013@gmail.com" target="_blank">baixx013@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">






<div dir="ltr"><div><div>Dear Denis,<br><br></div>I have installed MNE python. It can read EGI raw file.<br><br></div>Best<span><font color="#888888"><br><br>Xiaoxiao<br></font></span></div><div><div>

<div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 12:49 PM, Denis-Alexander Engemann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:denis.engemann@gmail.com" target="_blank">denis.engemann@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>







<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra">Hi Xiaoxiao,</div>






<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">
we meanwhile have direct reading + conversion support for EGI data</div><div class="gmail_extra">in MNE-Python (development version),</div>

<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Take a look at: mne.io.egi.read_raw_egi<br><br>It supports the native egi raw format.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Hope this helps,</div>









<div class="gmail_extra">Denis<div><div><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 6:38 PM, Xiaoxiao Bai <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:baixx013@gmail.com" target="_blank">baixx013@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>









<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Dgw,<br><br></div>









Thank you for you help. This file only includes signals of 128 channels with same sample rate. <br><br></div>After that, I input EGI Net Station data into BrainVision and 
then save as EDF file. This BrainVision EDF file can be converted to FIF
 file.<br>

<br>I used matlab toolbox to read this FIF file and its header information and data are correct.<br><br>But I can not display it in the mne_browse_raw (see attached screenshot).<br><br></div>Best<span><font color="#888888"><br>









<br></font></span></div><span><font color="#888888">Xiaoxiao<br>
</font></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 2, 2014 at 12:13 PM, dgw <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dgwakeman@gmail.com" target="_blank">dgwakeman@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>









<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div>Hi Xiaoxiao,<br><br></div>What types of data are in there? The error message suggests that there is data with different sampling rates. Do you have channels with different sampling rates? If yes, can you re-export the data removing the data with different sampling rates?<br>











<br></div><div>HTH,<br></div><div>D<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote"><div><div>On Wed, Jul 2, 2014 at 11:20 AM, Xiaoxiao Bai <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:baixx013@gmail.com" target="_blank">baixx013@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>











</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><div><div dir="ltr"><div><div><div>Hi all MEN users,<br>









<br></div>I used Net station to save recorded EEG data to EDF format. When I used mne_edf2fiff to convert our EDF file to FIF file, I got this error message,<br>

<br>$ mne_edf2fiff --edf Recording_9_fil.edf --fif Recording_9_fil.fif <br>
<br>mne_edf2fiff version 1.6 compiled at Dec 21 2009 19:46:35<br><br>EDF/EDF+/BDF file (input)  : Recording_9_fil.edf<br>No electrode position data specified.<br>fif file (output)          : Recording_9_fil.fif<br><br>Parsing EDF/EDF+/BDF header...[failed]<br>












Unequal sampling rates across data channels are not supported.<br><br></div>Best<span><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span><font color="#888888">Xiaoxiao<br></font></span></div>

<br></div></div>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></blockquote><blockquote type="cite"><div><span>_______________________________________________</span><br><span>Mne_analysis mailing list</span><br><span><a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a></span><br>



<span><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a></span><br><span></span><br><span></span><br><span>The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is</span><br>



<span>addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail</span><br><span>contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at</span><br><span><a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error</span><br>



<span>but does not contain patient information, please contact the sender and properly</span><br><span>dispose of the e-mail.</span><br></div></blockquote></div></div></div><br>_______________________________________________<br>




Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div></div></div>