<div dir="ltr">Fig1C shows the individual vectors and how they&#39;re weighted -- I was looking at Eq.8 which defines WPLI, and the paragraph that followed where they state that 0 ≤ Φ ≤ 1 holds (due to the absolute value operations in the numerator and denominator). But maybe there is more to it or you don&#39;t need to take the absolute value of the expectation in the numerator, in which case it could be -1 ≤ Φ ≤ 1, is that what you have in mind...?<div><br>Eric<br><div><span style="color:rgb(46,46,46);font-family:Arial,Helvetica,&quot;Lucida Sans Unicode&quot;,&quot;Microsoft Sans Serif&quot;,&quot;Segoe UI Symbol&quot;,STIXGeneral,&quot;Cambria Math&quot;,&quot;Arial Unicode MS&quot;,sans-serif;font-size:16px;word-spacing:-1.35px"><br></span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 14, 2017 at 3:13 PM, Andrea Brovelli <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:andrea.brovelli@univ-amu.fr" target="_blank">andrea.brovelli@univ-amu.fr</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <p>Dear all,</p>
    <p>I don&#39;t know the implementation in MNE, but, as far as I know,
      the WPLI ranges between between -1 and 1 (see Fig. 1C in Vinck,
      Neuroimage 2011). The same is for the imaginary coherence (Nolte,
      Clin Neurophysiol 2004).</p>
    <p>The strength of phase-synchronization can be indexed by the
      magnitude (or squared value) of the WPLI.<br>
    </p>
    <p>bye</p>
    <p>Andrea<br>
    </p>
    <p><br>
    </p>
    <p><br>
    </p>
    <p><br>
    </p>
    <div class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145moz-cite-prefix">Le 14-Jun-17 à 7:51 PM, Eric Larson a
      écrit :<br>
    </div><div><div class="m_-190081997442857463h5">
    <blockquote type="cite">
      
      <div dir="ltr">
        <div>Yes it looks like WPLI should be bounded by 0 and 1. Can
          you open an MNE issue so we can look into it further?<br>
          <div><br>
          </div>
          <div>Eric</div>
          <div><br>
          </div>
        </div>
      </div>
      <div class="gmail_extra"><br>
        <div class="gmail_quote">On Wed, Jun 14, 2017 at 1:28 PM, Stout,
          Jeffrey <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jstout@mcw.edu" target="_blank">jstout@mcw.edu</a>&gt;</span>
          wrote:<br>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
            <div link="blue" vlink="purple" lang="EN-US">
              <div class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145m_1176322043876479402WordSection1">
                <p class="MsoNormal">We are running analyses on resting
                  state MEG data and we are finding negative values in
                  the weighted phase lag index (wpli) measure.  We have
                  also run this data using the phase lag index (PLI)
                  measure and do not see any values below zero.  I
                  thought that both the PLI and WPLI should be defined
                  from 0 to 1.  Although the negative values tend to be
                  small, we are seeing this across many subjects.</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">wpli=np.load(&#39;connmat_wpli2_de<wbr>biased13_30hz_run1.npy&#39;)</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">np.min(wpli), np.max(wpli)</p>
                <p class="MsoNormal">Out[22]: (-0.0048496421426467845,
                  0.14954351856205442)    
                  &lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt; WPLI minimum
                  value below Zero</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">pli=np.load(&#39;connmat_pli13_30h<wbr>z_run1.npy&#39;)</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">np.min(pli), np.max(pli)</p>
                <p class="MsoNormal">Out[24]: (0.0, 0.21375066880684856)
                  &lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt;&lt; PLI minimum value
                  equals zero</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">Is this a correct finding?  Any
                  insight would be helpful.</p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal"> </p>
                <p class="MsoNormal">Thank you,</p>
                <p class="MsoNormal">Jeff Stout</p>
              </div>
            </div>
            <br>
            ______________________________<wbr>_________________<br>
            Mne_analysis mailing list<br>
            <a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.e<wbr>du</a><br>
            <a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.e<wbr>du/mailman/listinfo/mne_analys<wbr>is</a><br>
            <br>
            <br>
            The information in this e-mail is intended only for the
            person to whom it is<br>
            addressed. If you believe this e-mail was sent to you in
            error and the e-mail<br>
            contains patient information, please contact the Partners
            Compliance HelpLine at<br>
            <a href="http://www.partners.org/complianceline" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.partners.org/compli<wbr>anceline</a>
            . If the e-mail was sent to you in error<br>
            but does not contain patient information, please contact the
            sender and properly<br>
            dispose of the e-mail.<br>
            <br>
          </blockquote>
        </div>
        <br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre>______________________________<wbr>_________________
Mne_analysis mailing list
<a class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.e<wbr>du</a>
<a class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145moz-txt-link-freetext" href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.e<wbr>du/mailman/listinfo/mne_analys<wbr>is</a>


The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at
<a class="m_-190081997442857463m_-1765508610057670145moz-txt-link-freetext" href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/compli<wbr>anceline</a> . If the e-mail was sent to you in error
but does not contain patient information, please contact the sender and properly
dispose of the e-mail.
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </div></div></div>

<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.e<wbr>du</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.e<wbr>du/mailman/listinfo/mne_analys<wbr>is</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.partners.org/compli<wbr>anceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div></div>