<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="auto">If you update to the latest version of PySurfer the error should go away.<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Eric</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Mar 18, 2019, 00:47 Lin Wang &lt;<a href="mailto:wanglinsisi@gmail.com">wanglinsisi@gmail.com</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><p><span style="padding:3px 10px;border-radius:5px;color:#ffffff;font-weight:bold;display:inline-block;background-color:#ff0000">        External Email - Use Caution        </span></p><p></p><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi MNE experts,</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">When I tried to plot the source estimates using MNE python, I can only get the brain surfaces without activation blobs. The error seems to be about adding data to the brain surface.</div><div><br></div><div>Below is the error message:</div><div dir="ltr"><div><div>  <i>File &quot;&lt;ipython-input-131-d205f850633d&gt;&quot;, line 1, in &lt;module&gt;</i></div><div><i>    stc_grandavg.plot(hemi=&#39;split&#39;, initial_time=0.30, time_viewer=True,time_unit=&#39;s&#39;, colorbar=True, views=[&#39;lateral&#39;,&#39;medial&#39;,&#39;ventral&#39;])</i></div><div><i><br></i></div><div><i>  File &quot;/autofs/cluster/kuperberg/nonconMM/MEG/python/anaconda/lib/python2.7/site-packages/mne/source_estimate.py&quot;, line 1494, in plot</i></div><div><i>    spacing=spacing, verbose=verbose)</i></div><div><i><br></i></div><div><i>  File &quot;&lt;string&gt;&quot;, line 2, in plot_source_estimates</i></div><div><i><br></i></div><div><i>  File &quot;/autofs/cluster/kuperberg/nonconMM/MEG/python/anaconda/lib/python2.7/site-packages/mne/utils.py&quot;, line 803, in verbose</i></div><div><i>    return function(*args, **kwargs)</i></div><div><i><br></i></div><div><i>  File &quot;/autofs/cluster/kuperberg/nonconMM/MEG/python/anaconda/lib/python2.7/site-packages/mne/viz/_3d.py&quot;, line 1779, in plot_source_estimates</i></div><div><i>    min=scale_pts[0], max=scale_pts[2], **ad_kwargs)</i></div><div><i><br></i></div><div><i>TypeError: add_data() got an unexpected keyword argument &#39;verbose&#39;</i></div></div><div><br></div><div>I was able to do the plots using the same script and environment settings. I&#39;m not sure what went wrong here. Thanks a lot for your help!</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Lin</div></div></div>
_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank" rel="noreferrer">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a></blockquote></div>