<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear all,</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"><div>I am still stuck with the correspondence of the source space with parcellation. </div><div>I have a much better understanding on how functions&amp;data are organized after Mina Jamshidi&#39;s feedback on that but I am still missing something. <br></div><div>I thought that sources were organized the same way as the parcellation (source 1 corresponds to vertices 1 in the parcellation etc...). So, for a given source space (e.g. ico 4, 2562 sources per hemisphere) I would expect to find the vertices 0...2561 in the parcellation. Although there is a good correspondence between source, parcellation and lobes I cannot locate all my sources in the parcellation. </div><div><br></div><div>For instance, if I run the following:</div><div><br></div><div>import numpy as np<br>import mne<br>label=mne.read_labels_from_annot(&#39;fsaverage&#39;,parc=&#39;aparc&#39;,hemi=&#39;lh&#39;)<br>vertices=np.zeros(0,int)<br>for lab in label: vertices=np.hstack((vertices,lab.vertices))<br>vertices=np.sort(vertices)<br>print(vertices[2561])<br></div><div><br></div></div><div>I expected to get 2561 instead of 2792 so there is something about my belief that is wrong. </div><div><br></div><div>Does someone can help me to sort this out?</div><div><br></div><div>Thanks in advance</div><div><br></div><div>Thierry</div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div style="color:rgb(136,136,136)">Department of Biomedical and Clinical Sciences &quot;Luigi Sacco&quot;</div><div style="color:rgb(136,136,136)">University of Milan</div><div style="color:rgb(136,136,136)">Phone: +39 02 503 19731</div><div style="color:rgb(136,136,136)"><a href="https://maps.google.com/?q=via+G.+B.+Grassi+74+-+20157+Milano&amp;entry=gmail&amp;source=g" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">via G. B. Grassi 74 - 20157 Milano</a></div></div></div></div></div></div>
<p><br /><img src="cid:signature@unimi.it" alt="MailScanner Signature Unimi" /> <br />Il tuo 5 x mille progetti <br />Sostieni la ricerca, investi sul futuro dei giovani <br /><br />Universita` degli Studi di Milano - codice fiscale 80012650158</p>