<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="ltr">hi Sebastian,<div><br></div><div>the only thing I can suggest is that if you think the signal is in the time-frequency</div><div>power than you should not process electrodes separately but use dedicated</div><div>spatial filtering techniques that can boost SNR (See CSP, SpOC in the MNE-Python</div><div>documentation).</div><div><br></div><div>HTH</div><div>Alex</div><div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Jul 7, 2020 at 11:33 AM S.P.H. Speer &lt;<a href="mailto:speer@rsm.nl">speer@rsm.nl</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="NL"><p><span style="padding:3px 10px;border-radius:5px;color:rgb(255,255,255);font-weight:bold;display:inline-block;background-color:rgb(255,0,0)">        External Email - Use Caution        </span></p><p></p>
<div class="gmail-m_-3670674447210693337WordSection1">
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Hi Alex,<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black">I create subject level contrasts (conflict versus no conflict) and then want to run a group-level analysis where I want to use a continuous variable, which is an individual difference measure (number of trials on which the participant cheated),  as a predictor in a linear regression with t-values from the within subject contrasts (conflict versus no conflict) as dependent variable. Stated differently, I want to see whether frequency of cheating across individual can explain differences how conflict versus no conflict trials are modulated in the brain. <u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black">I’ve got the within-subject contrasts for each subject TF-maps one for each channel and am now wondering which function I can use to run this group-level analysis?<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Thanks for your help,<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="font-family:Calibri,sans-serif;color:black">Sebastian<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">hi Sebastian,<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">can you step back and explain the overall aim of the procedure?<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">what would you like to show with your data? is it group level?<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">a contrast?<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">Alex<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u> <u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">On Mon, Jun 29, 2020 at 6:14 PM S.P.H. Speer &lt;</span><span style="color:black"><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank"><span lang="EN-US">speer at rsm.nl</span></a></span><span lang="EN-US" style="color:black">&gt; wrote:<u></u><u></u></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i>         External Email - Use Caution<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> Dear MNE-team,<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> I’m trying to run a linear regression analysis on Time-Frequency data. I’ve got the average TFR for each for each subject and want to regress and individual difference measure on the time frequency data for a specific channel. The data has the same dimensions as for running linear regression on epochs but instead of channels I’m using frequencies. Unfortunately the linear_regression function provided by MNE does not allow TFR data as input. Is there a workaround for this problem? I would also like to run cluster-based permutation tests on the results of the linear regression to estimate significance. Would that be feasible?<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> Thank you very much for your help,<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> Sebastian<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i><u></u> <u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> _______________________________________________<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> Mne_analysis mailing list<u></u><u></u></i></span></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> </i></span><i><span style="color:black"><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank"><span lang="EN-US">Mne_analysis at nmr.mgh.harvard.edu</span></a></span></i><i><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u><u></u></span></i></pre>
<pre><span lang="EN-US" style="color:black">&gt;<i> </i></span><i><span style="color:black"><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank"><span lang="EN-US">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</span></a></span></i><i><span lang="EN-US" style="color:black"><u></u><u></u></span></i></pre>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><u></u> <u></u></span></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a></blockquote></div>