<div dir="ltr"><div><div>Thank you Denis,<br><br></div>Are there cases when it would be preferable to use the noise covariance?<br><br></div>Elena<br><div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 18 March 2015 at 16:04, Denis A. Engemann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:denis.engemann@gmail.com" target="_blank">denis.engemann@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="auto"><div>Hi Elena,</div><div><br></div><div>The defaults in ICA are good for what you want to do, channel-wise rescaling. See related examples on the webpage.</div><div><br></div><div><a href="http://martinos.org/mne/stable/auto_examples/preprocessing/plot_ica_from_raw.html" target="_blank">http://martinos.org/mne/stable/auto_examples/preprocessing/plot_ica_from_raw.html</a></div><div><br></div><div>Best,</div><div>Denis</div><div><div class="h5"><div><br>On 18 Mar 2015, at 15:46, Elena Orekhova &lt;<a href="mailto:orekhova.elena.v@gmail.com" target="_blank">orekhova.elena.v@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br></div><blockquote type="cite"><div><div dir="ltr"><div><div><div>Hello!<br><br>I would like to run ICA on Neuromag data (gradiometers + magnetometers).<br></div></div>As I understood, one can either use noise covariance matrix (from empty room data) or z-scoring to match the channel types. <br><br>Would the noise covariance be preferable?<br><br></div>Elena<br></div>
</div></blockquote></div></div><blockquote type="cite"><div><span>_______________________________________________</span><br><span>Mne_analysis mailing list</span><br><span><a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a></span><br><span><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a></span><br><span></span><br><span></span><br><span>The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is</span><br><span>addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail</span><br><span>contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at</span><br><span><a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error</span><br><span>but does not contain patient information, please contact the sender and properly</span><br><span>dispose of the e-mail.</span><br></div></blockquote></div><br>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div></div></div></div></div>