<div dir="ltr">Hi Alex,<div>I run</div><div>
<p style="margin:0px">stc_pow1 = mne.minimum_norm.source_induced_power(epochs, inverse_operator, frequencies = frequencies, label=None, lambda2=0.1111111111111111, </p>
<p style="margin:0px">                                                method=&#39;dSPM&#39;, nave=1, n_cycles=n_cycles, decim=10, use_fft=False, pick_ori= &#39;normal&#39;, </p>
<p style="margin:0px">                                                baseline=baseline, baseline_mode=&#39;logratio&#39;, pca=True, n_jobs=1, zero_mean=False, verbose=True, pick_normal=None)   </p>
<p style="margin:0px"><br></p><p style="margin:0px">Where &#39;epochs&#39; is the Maxfiltered, ICA-corrected data and epoched data.</p><p style="margin:0px"><br></p><p style="margin:0px">Elena</p><p style="margin:0px"><br></p></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 16 April 2015 at 10:48, Alexandre Gramfort <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:alexandre.gramfort@telecom-paristech.fr" target="_blank">alexandre.gramfort@telecom-paristech.fr</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">hi Elena,<br>
<br>
can you share a code snippet that produces the error?<br>
I tried setting pca=True in our example and it worked fine.<br>
<br>
Alex<br>
<div><div class="h5"><br>
<br>
On Wed, Apr 15, 2015 at 5:45 PM, Elena Orekhova<br>
&lt;<a href="mailto:orekhova.elena.v@gmail.com">orekhova.elena.v@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hello!<br>
&gt;<br>
&gt; I run mne.minimum_norm.source_induced_power<br>
&gt; with option pca=True<br>
&gt; (the data was Maxfiltered)<br>
&gt;<br>
&gt; However, in the output I see :<br>
&gt; ...<br>
&gt; Picked 306 channels from the data<br>
&gt; Computing inverse...<br>
&gt; (eigenleads need to be weighted)...<br>
&gt; Reducing data rank to 306<br>
&gt; Computing source power ...<br>
&gt;<br>
&gt; It seems that PCA does not work in this case.<br>
&gt; What can be wrong_<br>
&gt;<br>
&gt; Thank you!<br>
&gt; Elena<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
</div></div>&gt; _______________________________________________<br>
&gt; Mne_analysis mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
&gt; <a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
&gt; addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the<br>
&gt; e-mail<br>
&gt; contains patient information, please contact the Partners Compliance<br>
&gt; HelpLine at<br>
&gt; <a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in<br>
&gt; error<br>
&gt; but does not contain patient information, please contact the sender and<br>
&gt; properly<br>
&gt; dispose of the e-mail.<br>
&gt;<br>
_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br>
</blockquote></div><br></div>