<div dir="ltr">Dear list,<div><br></div><div>I&#39;m using the MNE Coregistration GUI tool to obtain the transformation matrix. </div><div><br></div><div>I&#39;m not able to figure out what co-ordinate system the scalp (shown in GUI) is in and which MRI volume it is directly related to - /mri/T1.mgz or /mri/orig/001.mgz ?</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><font color="#000000">--</font></div><div><font color="#000000">Regards,<br></font></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)"><div style="text-align:left"><font color="#000000">Kousik Sarathy, S</font></div></span></div><div style="text-align:left"><br></div></div></div></div>
</div></div>