<div dir="ltr">If you open an issue on the MNE-Python issue tracker and mention these use cases, it&#39;s possible that someone will find time to do it.<div><br></div><div>Eric</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 13, 2016 at 11:08 AM, GREGORY R KIRK <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:gkirk@wisc.edu" target="_blank">gkirk@wisc.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div>


<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Hi Alex,</p>
<p><br>
</p>
<p>So this functionality is still available in the c version ?<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>we have a very interesting measure derived from fMRI data</p>
<p>that we would like to establish the correspondence with electrical</p>
<p>activity source localized over frequency bands. We are submitting a grant</p>
<p>application with this as one of the aims. We have a very good research electrophysiologist</p>
<p>in our group. The data we will be working with is simultaneously acquired eeg/fmri</p>
<p>from UCL and possibly another site. Would there possibly be interest in collaborating to</p>
<p>implement something sensible ?</p>
<p><br>
</p>
<p>Best &amp; thanks</p>
<p><br>
</p>
<p>Greg<br>
</p>
</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> <a href="mailto:mne_analysis-bounces@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">mne_analysis-bounces@nmr.mgh.<wbr>harvard.edu</a> &lt;<a href="mailto:mne_analysis-bounces@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">mne_analysis-bounces@nmr.mgh.<wbr>harvard.edu</a>&gt; on behalf of Alexandre Gramfort &lt;<a href="mailto:alexandre.gramfort@telecom-paristech.fr" target="_blank">alexandre.gramfort@telecom-<wbr>paristech.fr</a>&gt;<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, September 13, 2016 2:28:42 AM<br>
<b>To:</b> Discussion and support forum for the users of MNE Software<br>
<b>Subject:</b> Re: [Mne_analysis] fmri spatial prior</font>
<div> </div>
</div>
</div><div><div class="h5">
<font size="2"><span style="font-size:10pt">
<div>Hi Greg,<br>
<br>
the python code does not implement fMRI weighting.<br>
<br>
that&#39;s what we have in the MNE-C doc:<br>
<br>
<a href="http://martinos.org/mne/stable/manual/source_localization/inverse.html?highlight=fmri#fmri-guided-estimates" target="_blank">http://martinos.org/mne/<wbr>stable/manual/source_<wbr>localization/inverse.html?<wbr>highlight=fmri#fmri-guided-<wbr>estimates</a><br>
<br>
quote:<br>
<br>
&quot;It turns out that the fMRI weighting has a strong influence on the<br>
MNE but the noise-normalized estimates are much less affected by it.&quot;<br>
<br>
as we recommend to use the noise-normalized estimates it has so far<br>
not been requested.<br>
<br>
Alex<br>
<br>
<br>
On Mon, Sep 12, 2016 at 7:40 PM, GREGORY R KIRK &lt;<a href="mailto:gkirk@wisc.edu" target="_blank">gkirk@wisc.edu</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hi folks,<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; seems i used to see some documentation for how to use an<br>
&gt;<br>
&gt; fmri spatial prior as a weighted constraint for the mne source<br>
&gt;<br>
&gt; modelling tools. Is such functionality available in the current version ?<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; thank you<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Greg<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; ______________________________<wbr>_________________<br>
&gt; Mne_analysis mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.<wbr>edu</a><br>
&gt; <a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.<wbr>edu/mailman/listinfo/mne_<wbr>analysis</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
&gt; addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the<br>
&gt; e-mail<br>
&gt; contains patient information, please contact the Partners Compliance<br>
&gt; HelpLine at<br>
&gt; <a href="http://www.partners.org/complianceline" target="_blank">http://www.partners.org/<wbr>complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in<br>
&gt; error<br>
&gt; but does not contain patient information, please contact the sender and<br>
&gt; properly<br>
&gt; dispose of the e-mail.<br>
&gt;<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.<wbr>edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.<wbr>edu/mailman/listinfo/mne_<wbr>analysis</a><br>
</div>
</span></font>
</div></div></div>

<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.<wbr>edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.<wbr>edu/mailman/listinfo/mne_<wbr>analysis</a><br>
<br>
<br>
The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br>
contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br>
<a href="http://www.partners.org/complianceline" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.partners.org/<wbr>complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in error<br>
but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br>
dispose of the e-mail.<br>
<br></blockquote></div><br></div>