<div dir="ltr">Hi Alex,<div><br></div><div>Don&#39;t know where to get the <span style="font-size:12.8px"> </span><span style="font-size:12.8px">-ave.fif file. I solved the problem by specifying the colormap: </span></div><div><span style="font-size:12.8px">evoked.plot_topomap(ch_type = &#39;eeg&#39;, times = t, vmin = 0.0, vmax = 1.5, scale = 1,average = 0.1,contours = 10</span><span style="font-size:12.8px">, <b>cmap = &quot;plasma&quot;</b>). See attached plot. </span><br></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">I think there is some weird default color scaling when the colormap is not specified. </span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">Best,</span></div><div><span style="font-size:12.8px">Mat</span></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-10-26 0:04 GMT-05:00 Alexandre Gramfort <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:alexandre.gramfort@telecom-paristech.fr" target="_blank">alexandre.gramfort@telecom-paristech.fr</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Mathieu,<br>
<br>
can you share the -ave.fif file to replicate?<br>
<br>
thanks<br>
Alex<br>
<div><div class="h5"><br>
<br>
On Tue, Oct 25, 2016 at 9:44 PM, Servant Mathieu<br>
&lt;<a href="mailto:servant.mathieu@gmail.com">servant.mathieu@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hi community,<br>
&gt;<br>
&gt; I just plotted the attached topographic voltage maps using the<br>
&gt; plot_topomap() function:<br>
&gt;<br>
&gt; t = [0.25,0.35, 0.45, 0.55, 0.65,  0.75,  0.85]<br>
&gt;<br>
&gt; evoked = EvokedArray(my_data, info=info, tmin=-0.2)<br>
&gt; evoked.plot_topomap(ch_type = &#39;eeg&#39;, times = t, vmin = 0.0, vmax = 1.5,<br>
&gt; scale = 1,average = 0.1,contours = 10)<br>
&gt;<br>
&gt; Seems that there&#39;s a bug with the colorbar: the color scale does not match<br>
&gt; the first 3 plots (there should not be any blue color). Any idea what&#39;s<br>
&gt; going on?<br>
&gt;<br>
</div></div>&gt; ______________________________<wbr>_________________<br>
&gt; Mne_analysis mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.<wbr>edu</a><br>
&gt; <a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.<wbr>edu/mailman/listinfo/mne_<wbr>analysis</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br>
&gt; addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the<br>
&gt; e-mail<br>
&gt; contains patient information, please contact the Partners Compliance<br>
&gt; HelpLine at<br>
&gt; <a href="http://www.partners.org/complianceline" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.partners.org/<wbr>complianceline</a> . If the e-mail was sent to you in<br>
&gt; error<br>
&gt; but does not contain patient information, please contact the sender and<br>
&gt; properly<br>
&gt; dispose of the e-mail.<br>
&gt;<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.<wbr>edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.<wbr>edu/mailman/listinfo/mne_<wbr>analysis</a><br>
</blockquote></div><br></div>