<div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Dear all,</span><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I&#39;m very happy to announce a preliminary support for uploading, visualizing and sharing surface maps in <span class="gmail-il">fsaverage</span> space in <span class="gmail-il">NeuroVault</span>.org. This is especially exciting for the MEG community which is often  using surface reconstruction to do source localization. Thanks to the support for surface data NeuroVault is not limited to MR and PET research outputs and can accommodate (and integrate) MEG outputs.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">The following features are currently supported:</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">1. Uploading .mgh, .curv, and .gii scalar maps:</div><div style="font-size:12.8px">2. Visualization of the surface map projected into the MNI volume (using MNI template surface reconstruction instead of <span class="gmail-il">fsaverage</span>)<br></div><div style="font-size:12.8px"><img src="cid:ii_ivei41ri2_15856088c97be7cd" width="545" height="425" class="gmail-CToWUd gmail-a6T" tabindex="0"></div><div style="font-size:12.8px">3. Downloading of the maps in GIFTI format (with metadata correction making viewing of the files in both Freeview and Connectome Workbench easy).</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Example map: <a href="http://neurovault.org/images/31996/" target="_blank">http://<span class="gmail-il">neurovault</span>.org/<wbr>images/31996/</a></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Thanks to the projection to the MNI volume space all of the extra analysis features of <span class="gmail-il">NeuroVault</span>(cognitive decoding using neurosynth, gene expression decoding using Allen Brain Atlas data, searching for maps with similar activation patterns) will work seamlessly.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">TODO (aka help needed):</div><div style="font-size:12.8px">1. Improve the surface reconstruction of the MNI atlas (the cortex is too thin in some areas)</div><div style="font-size:12.8px">2. Provide 3D visualization using brainbrowser</div><div style="font-size:12.8px">3. Add Connectome workbench scene files and include <span class="gmail-il">fsaverage</span> GIFTI surfaces in download packages.</div><div style="font-size:12.8px">4. Make volume projection asynchronous to improve response time (it takes several seconds to process one map right now leaving the user with no feedback).</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Please let me know what do you think! Don&#39;t forget to share your maps!</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Best,</div><div style="font-size:12.8px">Chris<br>​</div></div>