<div dir="ltr"><div><span style="font-size:12.8px">Dear MNE experts,</span><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I&#39;m currently working on ICA and I&#39;m really confused about an issue.</div><div style="font-size:12.8px">What makes me uncertain is a (possible) discrepancy between the topomap and the &quot;epochs image and ERP/ERF&quot;<i> </i>plots of <i>ica.plot_properties(). </i></div><div style="font-size:12.8px"><i><br></i>I&#39;ll give you an example: the two figures <a href="https://drive.google.com/open?id=0B4J_Mny93UZYZXFZRnVjV2w4OG8">in this link</a> show the ICA component IC#000, the first obtained with <i>ica.plot_properties(<wbr>epochs_clean, picks=0)</i>, the second from <i>ica.plot_sources(epochs_<wbr>clean)</i>.</div><div style="font-size:12.8px">The component in the sources plot shows positive spikes (eyeblinks?) and these can be noticed also in the top-right plot of the plot_properties. They are shown in red (positive) -- everything okay thus far.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I&#39;m getting confused looking at the topomap, though. Shouldn&#39;t it be red-ish? It is widespread and blue and it seems not to reflect  the data shown on the right!</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">The raw data looks ok, I&#39;ve looked into the documentation and asked an EEG expert (who&#39;s used EEGlab in the past), but we are clueless. I&#39;ve also tried a different ICA method, producing the same output. Could the two plots have different amplitude scales?</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px">Thank you all,</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Lorenzo Alfine</span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">MSc student, University of Padova</div></div></div></div>