<div dir="ltr">Hi all, <div><br></div><div>I am using mne to process some EEG data which I have collected from participants performing an oddball task. As might be expected, some of my channels are noisy in some part of the epoched data and I want to reject them. What I understand from MNE is that I can reject bad channels based on peak-to-peak amplitude by setting reject parameter when using &quot;mne.Epochs&quot; to epoch the data. This is very cool, but this rejects the whole epoch containing this noisy channel and throws out the data of good channels as well. The other possible way is to mark a channel as &quot;bad&quot; and then epoch the data from the remaining channels. The problem of this latter way is that some channels are noisy only in some part of the experiment and not in all the session.</div><div>My question is if there is any way to reject only bad channels in an epoch (instead of rejecting the whole epoch or rejecting a channel in the whole session)? </div><div><br></div><div>Thanks a lot, </div><div>Maryam</div><div><br></div><div><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font color="#0b5394">Maryam</font> </span><font color="#0b5394">Mokhberi</font></div><div dir="ltr"><font color="#0b5394">MASc Candidate<br>Institute of Biomaterials and Biomedical Engineerin</font><span style="color:rgb(11,83,148);font-size:12.8px">g</span></div><div><span style="color:rgb(11,83,148);font-size:12.8px">University of Toronto</span></div><div><br></div><div dir="ltr"><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>