<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Consolas,sans-serif;font-style:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">And I understand the vertices locations are unique for each subject, and thus we need to include the subjects paths. Is this correct?</div></div></blockquote><div><br></div><div>Yes each subject&#39;s vertices can be in different locations, so you have to morph from one to another to make them comparable.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Consolas,sans-serif;font-style:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">What if it was an averaged STC (if it can be)?</div></div></blockquote><div><br></div><div>If you want to average STCs, you need to morph them all to the same subject with stc.morph or stc.morph_precomputed.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Consolas,sans-serif;font-style:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">What shall we use as the &quot;subject path&quot; arguments?</div></div></blockquote><div><br></div><div>This should correspond to whatever `subject` structural you used to construct your source space, head&lt;-&gt;MRI trans, BEM, etc.</div><div><br></div><div>Eric</div><div><br></div></div></div></div>