<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p>Okay, I did the remove command like you suggested and then redid the curl command (said it was all there), then the conda env create command and it went through everything again. &nbsp;I got the errors about cython again. &nbsp;"which python" does indeed produce the correct result. &nbsp;I did the python command and then “import mne”. &nbsp;This time no error! &nbsp;conda list does include mne as one of the packages. &nbsp;:)<div class=""><br class=""></div><div class="">Thanks!</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Joe<br class=""><div><br class=""><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Jun 21, 2018, at 15:20, Eric Larson &lt;<a href="mailto:larson.eric.d@gmail.com" class="">larson.eric.d@gmail.com</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><p class=""><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;" class="">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><div class=""><br class="webkit-block-placeholder"></div><div dir="ltr" class=""><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space" class=""><div class="">When I wasn’t able to import MNE, I went back and saw the problem. &nbsp;.conda belonged to root rather than me and I didn’t have permission.&nbsp; I fixed the permissions problem and redid the conda env create -f environment.yml step.</div></div></blockquote><div class=""><br class=""></div><div class="">That's odd -- perhaps someone did a `sudo` operation at some point.</div><div class="">&nbsp;</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space" class=""><div class="">This time it mostly went fine all the way through.</div></div></blockquote><div class=""><br class=""></div><div class="">You might need to do `conda env remove -n mne` and then start over. Maybe there was some cruft left in there.</div><div class="">&nbsp;</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word;line-break:after-white-space" class=""><div class="">I’m not sure what to do at this point.&nbsp; Any assistance would be greatly appreciated!<br class=""></div></div></blockquote><div class=""><br class=""></div><div class="">You got this error after the `source activate mne` step? If you do `which python` does it tell you `~/anaconda3/envs/mne/bin/python`? Doing `conda list` will list all the packages currently available in the environment.</div></div></div>
_______________________________________________<br class="">Mne_analysis mailing list<br class=""><a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" class="">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br class="">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis<br class=""><br class=""><br class="">The information in this e-mail is intended only for the person to whom it is<br class="">addressed. If you believe this e-mail was sent to you in error and the e-mail<br class="">contains patient information, please contact the Partners Compliance HelpLine at<br class="">http://www.partners.org/complianceline . If the e-mail was sent to you in error<br class="">but does not contain patient information, please contact the sender and properly<br class="">dispose of the e-mail.<br class=""></div></blockquote></div><br class=""><div class="">
<div style="text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><div style="text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><div style="text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><div style="text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">--------------------------------------------------------------------------------<br class=""><br class="">Joseph Dien, PhD</div><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">Senior Research Scientist</div><div style="text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">Department of&nbsp;Human&nbsp;Development and&nbsp;Quantitative&nbsp;Methodology</div><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">University of Maryland, College Park</div><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-align: start; text-indent: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class=""><a href="http://joedien.com" class="">http://joedien.com</a></div></div></div></div></div>
</div>
<br class=""></div></body></html>