<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="ltr">Hi all, <div><br></div><div>I am trying to remove all eye artifacts from an EEG recording with an EOG channel using ICA (following the tutorial on MNE). I applied a bandpass filter (1 and 40Hz) to the signal and removed the default average reference. Then I fit ICA as follows:</div><div><br></div><div>picks = mne.pick_types(<a href="http://raw.info">raw.info</a>, eeg= True, eog= True, stim= False, exclude= &#39;bads&#39;)</div><div>ica= ICA(n_components=25, method=&#39;fastica&#39;, random_state=1)</div><div>ica.fit(raw, picks=picks, decim=3)</div><div><br></div><div>n_max_eog=2</div><div>eog_epochs=create_eog_epochs(raw, ch_name=&#39;EXG1&#39;)</div><div>eog_inds, scores= ica.find_bads_eog(eog_epochs)</div><div><br></div><div>As an output, this says only 2 EOG events detected (when there are many more blinks). I can add the reject criteria with reject=dict(eog=threshold) but I do not know what threshold to choose. I am relatively new to MNE. </div><div><br></div><div>I am attaching the link to the file, if it helps. <div class="gmail_chip gmail_drive_chip" style="width:396px;height:18px;max-height:18px;background-color:rgb(245,245,245);padding:5px;font-family:arial;font-weight:bold;border:1px solid rgb(221,221,221);line-height:1"><a href="https://drive.google.com/file/d/1Jyh_BBPGrnghIcNo1bDYD4yxevu_B4UI/view?usp=drive_web" target="_blank" style="display:inline-block;max-width:366px;overflow:hidden;text-overflow:ellipsis;white-space:nowrap;text-decoration:none;padding:1px 0;border:none"><img style="vertical-align: bottom; border: none;" src="https://ssl.gstatic.com/docs/doclist/images/icon_10_generic_list.png"> <span dir="ltr" style="color:rgb(17,85,204);text-decoration:none;vertical-align:bottom">Giannis_72518_Active.bdf</span></a><img src="//ssl.gstatic.com/ui/v1/icons/common/x_8px.png" style="opacity: 0.55; cursor: pointer; float: right; position: relative; top: -1px; display: none;"></div></div><div>Thanks for all your help! Really appreciate it. </div><div><br></div><div>-Neelesh</div><div><br></div></div>