<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="rtl"><div dir="rtl"><div dir="ltr">Hi <span style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,helvetica,sans-serif">Shuang</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,helvetica,sans-serif">, </span></div><div dir="ltr"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,helvetica,sans-serif">Thank you for responding.</span></div><div dir="ltr">Right now I&#39;m using an individual template, but anyway- the ITC is a vector which is not associated with any voxel or brain region.</div><div dir="ltr">I guess its in a scrambled order, and thats why when I insert the vector into a stc variable (structure) I can&#39;t see it properly on the brain plot.</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">any suggestions?</div><div dir="ltr">Paz</div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="rtl">‫בתאריך יום ד׳, 28 בנוב׳ 2018 ב-16:28 מאת ‪Shuang Geng‬‏ &lt;‪<a href="mailto:s.geng@bcbl.eu">s.geng@bcbl.eu</a>‬‏&gt;:‬<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><p><span style="padding:3px 10px;border-radius:5px;color:#ffffff;font-weight:bold;display:inline-block;background-color:#ff0000">        External Email - Use Caution        </span></p><p></p><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:#000000"><div>Hi Paz,<br></div><div>Did you check which template are you plotting on, on a average brain, or individual brain.<br></div><div><br></div><div><br></div><div>Shuang Geng<br>PhD Student BCBL<br><a href="http://www.bcbl.eu" target="_blank">www.bcbl.eu</a><br><br>Legal disclaimer/Aviso legal/Lege-oharra: <a href="http://www.bcbl.eu/legal-disclaimer" target="_blank">www.bcbl.eu/legal-disclaimer</a></div><br><hr id="m_-5212997305808681525zwchr"><div><b>From: </b>&quot;Paz Har-shai&quot; &lt;<a href="mailto:pazhs10@gmail.com" target="_blank">pazhs10@gmail.com</a>&gt;<br><b>To: </b>&quot;mne analysis&quot; &lt;<a href="mailto:mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a>&gt;<br><b>Sent: </b>Wednesday, November 28, 2018 3:14:41 PM<br><b>Subject: </b>[Mne_analysis] mne.minimum_norm.source_induced_power<br></div><br><div><p><span style="padding:3px 10px;border-radius:5px;color:#ffffff;font-weight:bold;display:inline-block;background-color:#ff0000">        External Email - Use Caution        </span></p><p></p><div dir="rtl"><div dir="rtl"><div dir="ltr">Hi,</div><div dir="ltr">I&#39;m using <span style="color:rgb(44,62,80);font-family:Lato,&quot;Helvetica Neue&quot;,Helvetica,Arial,sans-serif"><b>mne.minimum_norm.source_induced_power</b> in order to look at the phase locking (ITC) per voxel on a brain plot.</span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50">The problem is that this function returns the ITC values in a vector and not in a structure containing additional info such as labels etc. </span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50">The vector is not arranged in the correct order and thus I cannot plot the ITC per voxel on the brain plot (-p</span>roduces a meaningless graph..)<span style="color:rgb(44,62,80);font-family:Lato,&quot;Helvetica Neue&quot;,Helvetica,Arial,sans-serif">.</span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50">How can I re-arrange the vector in the correct order? Or- use a function that returns an structure output with the correct order of the voxels?</span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50"><br></span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50">Thank you,</span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50">Paz</span></div><div dir="ltr"><span style="color:#2c3e50;font-family:Lato,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif" face="Lato, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, sans-serif" color="#2c3e50"><br></span></div><div dir="ltr"><span style="color:rgb(44,62,80);font-family:Lato,&quot;Helvetica Neue&quot;,Helvetica,Arial,sans-serif"><br></span></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>Mne_analysis mailing list<br><a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br><a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a><br></div></div></div>_______________________________________________<br>
Mne_analysis mailing list<br>
<a href="mailto:Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu" target="_blank">Mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br>
<a href="https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis" rel="noreferrer" target="_blank">https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/mne_analysis</a></blockquote></div>