<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>I create noise projections from meg raw data to remove environmental artifacts (i.e., street car effects). I usually apply the projections to the data and then perform a ICA fit to remove other biological artifacts (i.e., ecg, eog). It seems like noise projections that are applied to the data are temporarily removed while fitting the ICA object to it. I can see that since the topographies of the noise projections are being replicated in ICA topographies. Is it true that even if the projections are applied to raw data before, they are kept separated while performing ICA fiting and added afterwards again? Can anyone tell me how it works in MNE?           <br></div><div><br></div><div>Best,</div><div>Dip<br></div></div>