<p><span style="padding: 3px 10px; border-radius: 5px; color: #ffffff; font-weight: bold; display: inline-block; background-color: #ff0000;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></p><p></p><div>Hi Bianca,<br></div><div>Can you have a look at <a href="https://github.com/mne-tools/mne-python/pull/7183">https://github.com/mne-tools/mne-python/pull/7183</a> and see if the docstring changes there are clear, and would have prevented your difficulty?<br></div><div><br></div><div class="protonmail_signature_block"><div class="protonmail_signature_block-user"><div>-- dan<br></div><div>Daniel McCloy<br></div><div>http://dan.mccloy.info<br></div><div>Research Scientist<br></div><div>Institute for Learning and Brain Sciences<br></div><div>University of Washington<br></div></div><div class="protonmail_signature_block-proton protonmail_signature_block-empty"><br></div></div><div><br></div><div>‐‐‐‐‐‐‐ Original Message ‐‐‐‐‐‐‐<br></div><div> On Saturday, January 4, 2020 3:24 PM, Bianca Islas &lt;biancaisla1@gmail.com&gt; wrote:<br></div><div> <br></div><blockquote class="protonmail_quote" type="cite"><p><span style="background-color:rgb(255, 0, 0)"><span style="color:rgb(255, 255, 255)"><b>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;External Email - Use Caution&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</b></span></span><br></p><p><br></p><div><p>Yes, entirely different.&nbsp; I first define an event_dict.&nbsp; My reading in the .cnt file is verbatim:<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>`raw = mne.io.read_raw_cnt(input_fname=raw_fname, eog=('VEO', 'HEO',), misc=('SCR', 'SCL',), ecg=('HR',),<br></p><p>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;emg=('PA-L-SCAL', 'PA-L-EAR', 'PA-R-SCAL', 'PA-R-EAR', 'ORB-NOSE', 'ORB-EAR', 'COR-NOSE', 'COR-EAR', 'ZYG-MOUTH', 'ZYG-EAR',),<br></p><p>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;data_format='int32', date_format='dd/mm/yy', preload=True)<br></p><p>events = mne.events_from_annotations(raw_corrected, event_id=event_dict)<br></p><p>print(events, raw_corrected) #corrected raw data after ICA`<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>Implementing `event_id=int` into `events_from_annotations`, as in your code, was the difference.&nbsp; This is not in the documentation for this <a href="https://mne.tools/stable/generated/mne.events_from_annotations.html">function</a>. So I’m glad we were able to cover it here.&nbsp; Thank you for your time and patience in clearing this up!<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>Bianca Islas<br></p><p>&nbsp;<br></p><div style="mso-element:para-border-div;border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in"><p style="border:none;padding:0in"></p><div><b>From: </b><a href="mailto:alexandre.gramfort@inria.fr">Alexandre Gramfort</a><br></div><div><b>Sent: </b>Saturday, January 4, 2020 8:50 AM<br></div><div><b>To: </b><a href="mailto:biancaisla1@gmail.com">Bianca Islas</a><br></div><div><b>Cc: </b><a href="mailto:mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu">mne_analysis@nmr.mgh.harvard.edu</a><br></div><div><b>Subject: </b>Re: Annotations for Events<br></div><p></p></div><p>&nbsp;<br></p><p>hi,<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>I tried<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>import mne<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>raw = mne.io.read_raw_cnt('st003_PAMR_s1079_20080319.cnt')<br></p><p>events, event_id = mne.events_from_annotations(raw, event_id=int)<br></p><p>print(events)<br></p><p>print(event_id)<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>and it worked fine.<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>are you doing anything differently?<br></p><p>&nbsp;<br></p><p>Alex<br></p><p>&nbsp;<br></p></div></blockquote><div><br></div>