Hi experts,
Will you please briefly explain to me the rationale behind why subjects put back into their original space after alignment to the template (fsaverage)? and also, how this is done.
Thanks so much,
Avi
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Hi Avi
we do all our analysis in native space, so there is no "putting back".
cheers Bruce On Wed, 22 Nov 2017, Avideh Gharehgazlou wrote:
Hi experts,
Will you please briefly explain to me the rationale behind why subjects put back into their original space after alignment to the template (fsaverage)? and also, how this is done. Thanks so much,
Avi
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does this answer your question?
https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsAnat-to-NativeAnat
On 11/22/17 9:29 AM, Bruce Fischl wrote:
Hi Avi
we do all our analysis in native space, so there is no "putting back".
cheers Bruce On Wed, 22 Nov 2017, Avideh Gharehgazlou wrote:
Hi experts,
Will you please briefly explain to me the rationale behind why subjects put back into their original space after alignment to the template (fsaverage)? and also, how this is done. Thanks so much,
Avi
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what do you mean? We generally don't move data from fsaverage to the individual space. All the anatomical analysis (recon-all) is done in the native space
On 11/21/2017 11:43 PM, Avideh Gharehgazlou wrote:
Hi experts,
Will you please briefly explain to me the rationale behind why subjects put back into their original space afteralignment to the template (fsaverage)? and also, how this is done.
Thanks so much,
Avi
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freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu