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Greetings freesurfuer community,
I've been working on a research project for which I need to simulate
different levels of inflation for a given brain MRI, to achieve so I have
tried the following so far:
1. To run recon-all for a test subject
2. To run mris_inflate over pial surfaces (as that's the structure I
need for my simulation)
3. To try to get back to a .nifti file by using mri_surf2vol. However I
have been unsuccessful with this step as the required --ribbon parameter
refers to ribbon.mgz which is a binary mask of segmented tissue. My
question: is there a way for me to generate a ribbon.mgz with the inflated
brain, or does anyone know how to get an inflated version of the brain that
I can use as an actual volume / image (.nifti, .mgz...)?
Thanks in advance!
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