Hi Bruce,
thanks for your fast reply.
I tryed to register a vesselmask on the brainmask.mgz with FSL. My aim was to bring this "combined" mask into a label structure, but the necessary label inputs are missing.
cheers Andreas
-------Originalmeldung-------
Von: Bruce Fischl Datum: 16.12.2016 17:57:42 An: Freesurfer support list Betreff: Re: [Freesurfer] Own ROI for cortical thickness measurements
Hi Andreas
what to you mean "I already tryed the mri_vol2surf and mri_vol2roi, unfortunately without successs." In what way didn't they work?
cheers Bruce On Fri, 16 Dec 2016, andinie@gmx.net wrote:
Dear Freesurfer-experts,
I want to create my own ROI for purposes of cortical thickness
measurements in Freesurfer. As input, I have a binary_volume_mask.mgz. But I m lacking to get this mask as a label or volume into the
FS structure.
I already tryed the mri_vol2surf and mri_vol2roi, unfortunately without
successs.
Looking forward to hearing your suggestion,
Best, Andreas Niebuhr
..........................................................................
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